一、使用范圍不同
店內碼是銷售者在其商品（如：店內散裝產品）沒有商品條形碼的情況下，在商店內部為方便自己管理，自行編制的臨時性代碼及條形碼標識，它只能在商店自己的內部系統使用，不適用于商店外的其他場合。
而商品條形碼是由一組規則排列的條、空及其對應的代碼組成的圖形，用于標識商品，是商品在全球通行的唯一“身份證”，使商品能在世界范圍內暢通無阻的流通，換言之，商品條形碼符合國際統一標準，能夠在全球范圍內對每類產品實現唯一編碼標識。
二、產生根源不同
店內碼是為了店內散裝食品，如方便鮮肉、水果、蔬菜等的結算所設計的，這類產品的特點是：以隨機數量銷售，沒有固定包裝，因此，企業很難衡量其具體規格和標準，所以無法承擔其編碼業務。
而市場上流通的零售商品，其外包裝都需要印制全球統一標準的商品條形碼。
三、覆蓋領域不同
店內碼具有封閉性，只能解決商店供應鏈中銷售管理的一環，用于商品內部管理。
商品條形碼具有開放性，它適用于供應鏈管理的各個環節，包括：生產運輸、倉儲、加工、配送等多個過程，使商品信息透明化，能為供應鏈的各個節點所共享，從而提高企業產品管理能力和競爭力。
通過以上介紹可以發現，商品條碼在應用范圍和效果上面都具有極大的優越性，如今，為了商品的流通，使得商品條碼在零售、電子商務、物流管理、醫療衛生、食品等各個行業被廣泛應用。而店內碼只能在其商品（如：散裝食品）沒有商品條碼的情況下，作為臨時的補充措施所使用。條碼生成軟件支持多種條碼碼制，有需求的用戶，可以下載軟件試用，這里就不再詳細描述了。